六味地黄汤治疗新生儿缺血缺氧性脑病lncRNA-miRNA-mRNA转录网络整合分析 六味地黄汤治疗新生儿缺血缺氧性脑病lncRNA-miRNA-mRNA转录网络整合分析六味地黄汤治疗新生儿缺血缺氧性脑病lncRNA-miRNA-mRNA转录网络整合分析

六味地黄汤治疗新生儿缺血缺氧性脑病lncRNA-miRNA-mRNA转录网络整合分析

↑点击关注↑投稿请直接登录

http://xxzz.cintcm.com

Abstract

运用生物信息学方法挖掘六味地黄汤治疗新生儿缺血缺氧性脑病(HIE)的lncRNA-miRNA-mRNA转录网络,探讨其作用机制。

通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)挖掘六味地黄汤活性成分及预测靶点,从GEO、miRDB、miRTarBase、TargetScan数据库挖掘HIE差异表达的lncRNAs、miRNAs及mRNAs,使用R语言及Perl软件筛选六味地黄汤治疗HIE的关键lncRNAs、miRNAs及mRNAs,借助Cytoscape3.7.0软件与STRING数据库构建活性成分-靶点网络、三元转录网络及蛋白互作网络,并进行GO功能及KEGG通路富集分析,最后予以分子对接评估。

挖掘出六味地黄汤33个活性成分,33个靶点与HIE相关。

得到由13个关键lncRNAs、20个关键miRNAs及33个关键mRNAs构成的三元转录网络,这些靶点主要通过PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路及IL-17信号通路等发挥抑制氧化应激、炎症反应及凋亡等作用。

六味地黄汤通过多靶点、多通路协同治疗HIE,可为相关临床及实验研究提供依据。

关键词

六味地黄汤;新生儿缺血缺氧性脑病;lncRNA;miRNA;竞争性内源RNA;生物信息学;网络药理学;分子对接

开放科学(资源服务)标识码(OSID)

作者语音介绍、在线问答、学术圈、开放科学数据与内容

引用格式:

陈博威,郑飘,易健,等.六味地黄汤治疗新生儿缺血缺氧性脑病lncRNA-miRNA-mRNA转录网络整合分析[J].中国中医药信息杂志,2021,28(7):27-34.

DOI:

10.19879/j.cnki.1005-5304.202005095

下载PDF◁

<<滑动查看下一页>>

拓展阅读

2021年7期目录

《中国中医药信息杂志》加入中国知网《中国学术期刊(网络版)》网络首发作者告知书

《中国中医药信息杂志》加入OSID开放科学计划告知书

六味地黄汤对慢性肾衰竭大鼠肾组织ZO-1、N-cadherin及Vimentin表达的影响

金匮肾气丸及六味地黄丸对自然衰老小鼠血浆代谢物的影响

提示:

点开乱码可能与iOS系统及微信软件版本有关,建议更新至最新版或使用电脑端、其他系统设备打开。

中国中医科学院中医药信息研究所

杂志出版中心

中国中医药信息杂志

微信号:

zgzyyxxzz

登录官网

版权申明: 本站文章来源于网络或网友自行上传,如果有侵权行为请联系站长及时删除。

赞 ( 1) 打赏

评论

9+4=

此站点使用Akismet来减少垃圾评论。 了解我们如何处理您的评论数据